離子色譜儀由淋洗液系統、色譜泵系統、進樣系統、流路系統、分離系統、化學抑制系統、檢測系統和數據處理系統等組成。
一、淋洗液系統：
離子色譜儀常用的分析模式為離子交換電導檢測模式，主要用于陰離子和陽離子的分析。
常用陰離子分析淋洗液有OH根體系和碳酸鹽體系等，常用陽離子分析淋洗液有甲烷磺酸體系和草酸體系等。
淋洗液的一致性是保證分析重現性的基本條件。為保證同一次分析過程中淋洗液的一致性，在淋洗液系統中加裝淋洗液保護裝置，可以將進入淋洗液瓶的空氣中的有害部分吸附和過濾，如CO2和H2O等。
二、色譜泵系統：
1、材質：
離子色譜的淋洗液為酸、堿溶液，與金屬接觸會對其產生化學腐蝕。如果選擇不銹鋼泵頭，腐蝕會導致色譜泵漏液、流量穩定性差和色譜柱壽命縮短等。離子色譜泵頭應選擇全PEEK材質（色譜柱正常使用壓力一般小于20MPa）。
2、類型：
（1）單柱塞泵。
（2）雙柱塞泵：
1）串聯雙柱塞泵。
2）并聯雙柱塞泵。
3、壓力脈動消除方式：
（1）電子脈動抑制。
（2）脈沖阻尼器。
三、進樣系統：
進樣系統是將常壓狀態的樣品切換到高壓狀態下的部件。保證每次工作狀態的重現性是提高分析重現性的重要途徑。
1、進樣閥：
（1）材質：
與色譜泵類似，選擇全PEEK材質的進樣閥才能保證儀器的壽命和分析結果的準確性。
（2）類型：
1）手動進樣閥：進樣一致性靠人，系統集成性差。
2）電動進樣閥：進樣一致性較好，系統集成性高。
2、自動進樣器：
進樣一致性最好，系統集成性最好。
四、流路系統：
采用色譜專用管路、接頭及其它連接部件，保證全塑無污染溶出，保證材料的可靠性和使用壽命。
材料有PEEK管（高壓區）、PTFE管、硅膠管（氣路或廢液用）、各種接頭和連接配件。
五、分離系統：
分離系統是離子色譜的重要部件，也是主要耗材。
1、預柱：
又稱在線過濾器，PEEK材質，主要作用是保證去除顆粒雜質。
2、保護柱：
保護柱與分析柱填料相同，消除樣品中可能損壞分析住填料的雜質。如果不一致，會導致死體積增大、峰擴散和分離度差等。
3、分析柱：
有效分離樣品組分。
六、化學抑制系統：
抑制系統是離子色譜的核心部件之一，主要作用是降低背景電導和提高檢測靈敏度。抑制器的好壞關系到離子色譜的基線穩定性、重現性和靈敏度等關鍵指標。
1、柱－膠抑制：
采用固定短柱或現場填充抑制膠進行抑制，不同的抑制柱交替使用，屬于間歇式抑制。
2、離子交換膜抑制：
采用離子交換膜，利用離子濃度滲透的原理進行抑制。
需要配制硫酸再生液，系統需要配置氮氣或動力裝置。
3、電解自再生膜抑制：
利用電解水產生媒介離子和離子配合離子交換膜進行抑制（最佳選擇）。
七、檢測系統：
離子色譜最基本和常用的檢測器是電導檢測器，其次是安培檢測器。
1、電導檢測器：
電導檢測器是基于極限摩爾電導率應用的檢測器，主要用于檢測無機陰陽離子、有機酸和有機胺等。
（1）雙極脈沖檢測器：
在流路上設置兩個電極，通過施加脈沖電壓，在合適的時間讀取電流，進行放大和顯示。
容易受到電極極化和雙電層的影響。
（2）四極電導檢測器：
在流路上設置四個電極，在電路設計中維持兩測量電極間電壓恒定，不受負載電阻、電極間電阻和雙電層電容變化的影響，具有電子抑制功能（陽離子檢測支持直接電導檢測模式）。
（3）五極電導檢測器：
在四極電導檢測模式中加一個接地屏蔽電極，極大提高了測量穩定性，在高背景電導下仍能獲得極低的噪聲，具有電子抑制功能（陽離子檢測支持直接電導檢測模式）。
2、安培檢測器：
安培檢測器是基于測量電解電流大小為基礎的檢測器，主要用于檢測具有氧化還原特性的物質。
（1）直流安培檢測模式：
主要用于抗壞血酸、溴、碘、氰、酚、硫化物、亞硫酸鹽、兒茶酚胺、芳香族硝基化合物、芳香胺、尿酸和對二苯酚等物質的檢測。
（2）脈沖安培檢測模式：
主要用于醇類、醛類、糖類、胺類（一二三元胺，包括氨基酸）、有機硫、硫醇、硫醚和硫脲等物質的檢測。
不可檢測硫的氧化物。
（3）積分脈沖安培檢測模式：
為脈沖安培檢測的升級檢測模式，適用于檢測脈沖安培檢測的物質。
八、數據處理系統：
完成數據處理，聯通儀器。
